Séquençage du patrimoine génétique des lignées végétales utilisées. Image: Shutterstock
Depuis janvier 2021, des chercheurs de l'Institut Leibniz de génétique végétale et de recherche sur les plantes cultivées (IPK) et de l'Université Christian-Albrecht de Kiel ont cherché des approches pour la détection et l'identification des plantes dont le génome a été modifié par les nouvelles techniques génomiques (NTG) ; ils ont aussi testé leur utilisation pratique. Au cours des trois années qu'a duré le projet, les chercheurs ont réussi à développer des méthodes d'analyse permettant de détecter des mutations - connues auparavant - dans des lignées NTG. En outre, des indices d'une approche analytique qui pourrait - dans certains cas - être utilisée pour identifier les lignées NTG en tant que telles, c'est-à-dire pour les distinguer d'une lignée conventionnelle présentant la même mutation, ont été confirmés au cours du projet de recherche, écrivent les chercheurs. Les expériences ont été menées en système fermé, sans dissémination.
Le projet est parti de lignées d'orge et de colza dans le patrimoine génétique desquelles les chercheurs des instituts participants ont introduit de manière ciblée de petites modifications (mutations) à l'aide des ciseaux génétiques CRISPR/Cas. Pour la détection des mutations, des approches basées sur les procédés de réaction en chaîne par polymérase (PCR) et de séquençage de nouvelle génération (NGS) ont été testées. Pour l'identification, les chercheurs ont suivi l'approche consistant à utiliser d'autres mutations dans le patrimoine génétique des lignées NTG qui se trouvent à proximité de la mutation induite et qui ne sont pas présentes dans les lignées de comparaison.
Pour les lignées d'orge et de colza étudiées, deux méthodes d'analyse ont pu être établies, qui ont permis de détecter de manière fiable les mutations introduites, même dans des mélanges de semences contenant seulement des quantités de 0,9% et 0,1%. Les laboratoires de référence accrédités participant au projet ont optimisé les méthodes et les ont testées avec succès en termes de spécificité, de sélectivité et d'applicabilité.
Procédures de détection et d'identification requises pour les contrôles officiels
Les plantes dont le patrimoine génétique a été modifié à l'aide de nouvelles technologies génétiques (NTG) sont actuellement soumises à la réglementation sur les organismes génétiquement modifiés (OGM) dans l'UE et en Suisse. Pour le contrôle du marché et comme condition préalable à la mise en circulation d'OGM, il est nécessaire de disposer de méthodes de détection et d'identification fiables pour le contrôle officiel afin de pouvoir distinguer les produits issus de l'édition du génome des produits de culture classiques - c'est-à-dire de les identifier sans équivoque. Les méthodes de détection des OGM disponibles jusqu'à présent, qui permettent de détecter des séquences d'ADN étrangères connues, ne peuvent être appliquées que de manière limitée aux plantes NTG qui ne contiennent pas de telles séquences d'ADN.
Cependant, l'étude montre que l'intervention qui doit être recherchée doit être documentée et connue avec précision. Pour s'en assurer, les entreprises qui souhaitent commercialiser des plantes NTG devraient être obligées de mettre à disposition des autorités de contrôle des informations sur le patrimoine génétique et du matériel de référence, écrit le service d'information sur le génie génétique. Selon la situation juridique actuelle, elles ne sont obligées de le faire que si elles demandent une autorisation pour leur plante dans l'UE ou en Suisse. C'est pourquoi il est actuellement difficile pour les autorités de développer des méthodes de test, de détection et d'identification pour quatre plantes NTG qui sont déjà commercialisées en dehors de l'Europe.
L'étude actuelle, commandée par l'Office fédéral allemand de l'agriculture et de l'alimentation, montre que la détection et l'identification des plantes NTG seront possibles à l'avenir, à condition que les projets de recherche correspondants soient lancés et encouragés. Refuser de réglementer les nouveaux procédés de génie génétique sous prétexte que leur détection est trop difficile, voire impossible, comme l'affirment constamment l'industrie agricole et une partie des milieux scientifiques et politiques qui lui sont liés, n'est donc plus défendable en toute bonne conscience.
- Étude de faisabilité sur les "méthodes de détection et d'identification des plantes et produits végétaux produit par édition génomique" est terminée : Institut fédéral allemand pour l'agriculture et l'alimentation
- Méthode de détection développées pour le colza et l'orge édités par le génome, Informationsdienst Gentechnik, 01.08.2024
